フコイダンには、ピロリ菌阻止作用・抗酸化作用・コレステロール低下作用・高血圧低下作用などなどさまざまな健康効果があります。なかでも主要３大作用と言われるものが次の三大効果です。
１、アポトーシス誘導作用
他の正常な細胞は傷つけづに、ガン細胞だけを死滅させてしまうフコイダン特有の働きです。
1996年第55回「日本癌学会総会」での発表を機にその後、幾度となくフコイダン抗がん作用の発表が行われています。フコイダンの最大の効果がこのアポトーシス誘導作用です。
２、免疫力増強作用
免疫力を高めておけば、生活習慣病をはじめとする様々な病気の予防になり、治りやすくもなります。外部から体内に侵入する病原菌を「自分でないもの」と認識して、体内から排除する、つまり、免疫力とは、私たちの身体に備わっている防衛システムのことです。フコイダンにはこの免疫力強化作用があります。
３、新生血管抑制作用
ガン細胞が増殖するためには、栄養吸収するための補給路として新しい血管（新生血管）を形成する必要があります。 ガン細胞が増殖・転移する時、ガン細胞は近くの血管に信号を送って新しい血管を作り栄養素と酸素を取り込みます。元々ある血管から新しい血管を形成することで腫瘍の成長を促すのです。フコイダンはガン細胞が発するこの信号を無力化し、新生血管を作ることを抑制します。
